在《名侦探柯南》剧场《贝克街的亡灵》中，结局使用红酒来缓冲列车的原因主要是 为了减轻火车冲进站或翻车时所受到的撞击力。具体解释如下：

物理原理：

红酒作为液体，可以有效地减轻冲击力。液体在受到冲击时，能够分散和吸收能量，从而减少传递到人体的力。这与某些易碎物品用海绵或泡沫包裹后运送的情形类似，都是利用液体的缓冲作用来保护内部物品。

情节需要：

在这个剧情中，柯南和小兰一起跳下火车，而红酒被用来减轻他们受到的冲击力。小兰为了让柯南活下去，牺牲了自己，跳下了火车。柯南在手风琴男人的指示下，明白了借助红酒回到现实的线索，并最终通过打碎红酒，利用酒水的冲劲回到了现实世界。

安全考虑：

红酒的密度比水略小，人和酒的密度近似相等。根据广义相对论等效原理，人在液体中处于悬浮状态，只需要承受液体的压力。三倍重力加速度并不会产生太大的液体压力，因此他们在红酒中相对安全。此外，车厢的密封性并不好，液体很快流尽，也不会导致他们溺亡。

综上所述，红酒在这个剧情中被用作缓冲物，主要是利用其物理特性来减轻冲击力，保护角色免受致命伤害。同时，这个情节也增加了故事的戏剧性和紧张感，为观众带来了更加震撼的观影体验。