《亲爱的阿基米德》的结局并没有明确说明。以下是一些可能的解读：

伯特掉落海中：

有观点认为，小说最后写伯特为了保护甄爱而掉进了海里，个人觉得应该不太可能还活着了。如果他还活着的话肯定是亚瑟把甄爱接回城堡的时候一起救回来的，但是在城堡里好像只有亚瑟和甄爱。伯特如果还活着的话一定会去见他的Little C啊，心疼。

亚瑟放走甄爱：

有观点认为，最后不是甄爱执意要回去找言溯所以亚瑟放走了她。亚瑟比较理智，如果是伯特的话就就不会放了，毕竟伯特比较变态。

甄爱与言溯的关系：

有观点认为，甄爱和言溯的孩子应该是言溯的，言溯可能不知道这个孩子的存在。亚瑟放走甄爱是因为他爱甄爱，而且他比较理智。

甄爱哥哥的身份：

有观点认为，甄爱的哥哥竟然是言溯的知己之交，而二者的联系竟然远在甄爱的少年时期就已产生。甄爱的背景和组织头目亚瑟、伯特对她的感情也注定了她要与组织有着扯不断的关系。

综合以上信息，可以推测《亲爱的阿基米德》的结局中，伯特可能已经牺牲，而甄爱和言溯的关系得到了进一步的发展，且甄爱的背景和组织头目亚瑟、伯特对她的感情也注定了她要与组织有着扯不断的关系。但具体的结局细节并未在小说或相关讨论中明确说明。