在施工总承包管理模式中，分包合同的签订通常有以下几种情况：

由业主直接签订

一般情况下，分包合同由业主与分包单位直接签订。分包单位由业主通过招标选择，并由业主直接与分包单位签订合同。

由施工总承包管理单位与分包单位签订

在业主要求且施工总承包管理单位同意的前提下，分包合同也可由施工总承包管理单位与分包单位签订。

有时，在业主要求下并且在施工总承包管理单位同意的情况下，分包合同也可以由施工总承包单位与分包单位签订。

经过施工总承包管理单位认可

每一个分包人的选择和每一个分包合同的签订都要经过施工总承包管理单位的认可，因为施工总承包管理单位要承担施工总体管理和目标控制的任务和责任。

综上所述，在施工总承包管理模式中，分包合同主要由业主直接签订，但在特定情况下，也可以由施工总承包管理单位与分包单位签订，并且需要经过施工总承包管理单位的认可。因此，最常见的情况是业主与分包单位直接签订合同。