文章《与朱元思书》分为三个文段，它们之间的关系是 总分总的结构。

第一段：

总叙富春江水的奇山异水，概括了从富阳到桐庐一带的山水特点，即“奇山异水，天下独绝”。

第二段：

描写富春江“异水”的特点，具体从水的颜色、清澈度、以及水中的生物等方面进行细致描绘，如“水皆缥碧，千丈见底；游鱼细石，直视无碍。急湍甚箭，猛浪若奔”。

第三段：

描写富春江“奇山”的特点，从山势、山间景物等方面进行描述，如“夹岸高山，皆生寒树。负势竞上，互相轩邈，争高直指，千百成峰”。

总结起来，文章先总述了富春江的山水之美，然后分别详细描写了“异水”和“奇山”的特点，最后再总结全文，强调其独特性。这种结构使得文章层次分明，条理清晰，充分展现了富春江的奇丽景色。