红酒瓶顶有两个小孔的主要作用如下：

排气作用：

在软木塞封瓶的过程中，小孔用于排气。在机械套帽的过程中，空气阻力会在瓶帽和瓶口之间形成气压，导致机械生产速度变慢。此外，小孔还能防止在滚帽（锡箔帽）和加热（热塑帽）时，空气被封闭在酒帽中，影响封帽外观。

平衡内外气压：

小孔有助于平衡瓶帽内外的气压，防止瓶塞在运输和储藏过程中松动或脱落。

换气作用：

红酒在瓶内会进行微量的呼吸和轻微发酵，小孔可以允许少量空气进入瓶内，促进酒液的氧化，从而使其风味更加复杂并延长寿命。

方便开瓶：

小孔也方便人们打开瓶盖。

综上所述，红酒瓶顶的两个小孔主要是为了排气、平衡气压、促进酒液的氧化和方便开瓶。这些设计对葡萄酒的品质和保存有着积极的影响。