葡萄酒在酒杯上留下颜色的原因主要有以下几点：

单宁和色素的附着：

葡萄酒中含有单宁和天然色素，尤其是红葡萄酒。当喝完葡萄酒后，如果没有及时清洗杯子，这些物质会附着在杯壁上，导致杯子染色。

葡萄皮中的色素：

红葡萄酒在发酵过程中会与葡萄皮接触较长时间，萃取了葡萄皮中的红色素，这些色素会在杯壁上形成色垢。

酒体稠度：

有些葡萄酒酒体较稠，类似于稀薄的糖浆，喝完后会在杯壁上留下一层酒迹，使杯子看起来变红。

沉淀物：

如果葡萄酒存放时间过长或已经变质，酒中会产生沉淀物。这些沉淀物可能是固体小颗粒，附着在杯壁上，导致颜色变化。

挂杯现象：

在品酒过程中，旋转或摇晃酒杯后，酒液沿杯壁流下形成的泪痕状痕迹，称为挂杯或酒泪。这是由于葡萄酒中的酒精和其他挥发性化合物挥发后留下的液体在杯壁上形成的液膜逐渐变厚并流下所致。

综上所述，葡萄酒在酒杯上留下颜色主要是由于单宁和色素的附着、葡萄皮中的色素、酒体稠度、沉淀物以及挂杯现象所致。为了保持酒杯的清洁和美观，建议在喝完葡萄酒后及时清洗杯子。