3公分石材厚度的允许偏差通常为 正负3mm。具体来说：

一般误差范围 ：3mm以内是最多的误差范围。

机械加工精度：

由于国内花岗岩机械加工精密度有限，误差通常在正1mm，负2mm之间。

国家标准

厚度小于或等于15mm时，允许极限偏差为1.0mm。

板材厚度大于15mm时，同一块板材上厚度允许极限偏差为2.0mm。

室外石材铺装厚度上允许的误差范围：异形石材规格尺寸小于或等于15mm，同一块板材上的厚度允许极差为1.5mm；板材厚度大于15mm时，同一块板材上的厚度允许极差为3.0mm。

综合以上信息，可以得出结论：3公分石材厚度的允许偏差为 正负3mm。这一标准适用于大多数情况，但在具体应用中，可能需要根据实际需求和使用场景进行适当调整。