《花钟》这篇文章的说明方法主要包括以下几种：

举例说明：

文章通过列举具体的植物（如牵牛花、野蔷薇、龙葵花等）在不同时间开放的现象，来说明不同植物开花时间不同的特点。

归纳现象：

作者首先观察并总结了不同花朵在一天之内的开放时间，这是一个归纳的过程，通过观察到的现象来引出后续的分析和解释。

揭示原因：

文章进一步分析了导致不同花朵在不同时间开放的原因，主要包括温度、湿度、光照以及昆虫的活动时间等因素。

实际运用：

最后，文章提到了植物学家如何利用这些信息修建“花钟”，以此来报道时间，展示了花钟在实际生活中的应用。

设问和拟人：

在说明过程中，文章可能还运用了设问和拟人的修辞手法，以增强文章的可读性和趣味性。

时间顺序：

文章按照时间顺序排列，从早晨到夜晚，描述了不同花朵的开放时间，使得说明更加有条理。

通过这些说明方法，文章不仅清晰地展示了不同植物开花时间的规律，还介绍了花钟的制作和应用，使读者能够更好地理解植物开花与时间的关系。